자연계에 있는 펩타이드와 달리 화확적 합성에 의한 펩타이드는 C Terminal 에서 N Terminal로 이루어진다.

화학적 합성에는 고전적인 Liquid Phase방법과 Solid Phase방법이 있고 현재에는 자사를 포함한 대부분의 합성서비스 제조 업체는 Solid Phase로 합성을 진행한다. 하지만 Liquid Phase합성은 대량 생산에 효율이 좋아 종종 아직 상업적으로 대량 생산을 위해 이용되고 있다.

 현재 자사가 펩타이드 합성을 하는 Solid Phase 방법은 간략히 아래와 같이 이루어지고 있다.

먼저 Solid Phase Peptide Synthesis(SPPS)는 반복인Deprotection-Washing-Coupling-Wash단계로 그림과 같이 이루어진다.

펩타이드 합성은 Alpha Amino Group을 보호하기 위하여 Fmoc 와 t-Boc를 기반으로 이루어진다.

이 보호기는  deprotection agent인 piperidine for Fmoc, TFA for Boc에 의해Alpha Amino Group에서 떨어지고 합성 서열에 따른 다음 서열의 아미노산과Cuoupling과정이 이루어지고 다양한 reagents에 의해 반복적으로 Peptide Bond 진행된다. 이렇게 서열에 따른 합성이 완료되면 합성 Resin으로 부터 분리되고 Deprotection된다.

 이렇게 얻어진 Crude Peptide는 합성이 정확이 이루어졌는지 확인하기 위해 Mass를 찍고 원하고자하는 Peptide가 확인이되면 HPLC 정제 과정이 진행된다.

 먼저 HPLC정제를 위해 Crude Peptide를 증류수에 녹이고 Stationary Phase로 Water를 Mobile Phase로 Acetonitrile을 이용한다.

다음으로 Gradient를 다루게 적용하여(통상 20~40) 원하는 순도의 펩타이드를 분리정제하고 냉동 건조 과정을 거쳐 전과정의 펩타이드 합성이 완료된다.